U cilj kolegija je upoznati studenta temeljnim znanjima o glavnim karakteristikama mikroorganizama, struktura i funkcija prokariotske stanice i razlike u odnosu na eukariotske stanice. Osnove njihovog metabolizma (procesi respiracije i fermentacije), načine ishrane, mikrobni rast i razmnožavanje, parametri koji utječu na njihovu rasprostranjenost u različitim sredinama (tlo, voda, biljne sirovine i hrana)i njihove međusobne interakcije. Znanje iz mikrobiologije tla omogućava studentu uvid u kruženje tvari i hraniva koji su pod direktnim utjecajem mikroorganizama tla kruženje ugljika i dušika (amonifikacija, nitrifikacija, denitrifikacija i biološka fiksacija).